زيره سياه در موارد بلع هوا، نفخ شکم، برطرف کردن سوءهاضمه، تسهيل هضم غذا، دل پيچه کودکان، انگل معده و روده، دفع بادهاي کليه و مثانه، تنگی نفس، خفقان سرد، سکسکه نفخی، استسقاء به‌کار مي‌رود.
زيره سیاه دارای خاصيت ضدگرفتگی دارد و براي رفع گرفتگی های دوران قاعدگی مفيد است.
مقوی بدن و چاق کننده است. معده را گرم و تقويت می کند و کرم تنيا را دفع‌می کند. و اثر قابل ملاحظه‌ای در جلوگيری از ايجاد بادهای اضافی در روده و درمان‌اسهال دارد.
مصرف عرق زیره در بعضی افراد موجب اسهال و در برخی دیگر باعث یبوست می‌شود. بیماران کلیوی، کبدی و تنفسی و همچنین مادران باردار قبل از استفاده از عرق زیره، لازم است با پزشک خود مشورت کنند. خود سرانه عرق زیره را به کودکان ندهید. زیاده روی در مصرف زیره به علت طبع گرم ایجاد کهیر می کند.